تحليل شامل لميكروبيوم الحليب
رؤى الميكروبيوم لتعزيز صحة القطعان
يمكّن GTx-Milk مزارعي الألبان والأطباء البيطريين ومسؤلي القطعان والباحثين والعلماء في صناعة الألبان من الحصول على رؤى عملية حول الميكروبيوم لتمكين الكشف المبكر عن التهاب الضرع، والحد من تكراره، وتحسين استراتيجيات العلاج، وحماية إنتاجية القطعان على المدى الطويل.
متطلبات العينة:
- نوع العينة: حليب الحويصلات، ويتم جمعه عادةً في نهاية عملية الحلب. غالبًا ما تكون العينات مركبة (مختلطة من جميع الأرباع) أو عينات فردية من كل ربع (الربع: فص أو جزء مميز من ضرع البقرة)
- الحجم: حوالي 5-10 مل (حليب الحويصلات) أو 15-20 مل (عينة حليب عامة)
- متطلبات الجمع: تتطلب ظروف تعقيم صارمة. يجب التخلص من التدفقات القليلة الأولى من الحليب، ويجب تطهير أطراف الحلمات جيدًا (على سبيل المثال باستخدام الإيثانول 70٪).
- التخزين : يتم نقل العينات وتخزينها فورًا في درجات حرارة منخفضة (على سبيل المثال، -20 درجة مئوية أو -80 درجة مئوية) قبل استخلاص الحمض النووي.
الميزات الرئيسية:
- تحليل عالي الدقة لميكروبيوم للحليب: تحليل عالي الإنتاجية للمجتمعات البكتيرية في عينات الحليب باستخدام تحليل تسلسل الحمض النووي الريبي 16S والتحليل الشامل لتسلسل النكليوتيدات للميتاجينوم لتقديم معلومات دقيقة ومفصلة حول الميكروبات، بما في ذلك الضراوة ومقاومة المضادات الحيوية والأنشطة الأيضية.
- تصنيف حالات التهاب الضرع: يميز بدقة بين التهاب الضرع الصحي، والتهاب الضرع تحت السريري، والتهاب الضرع السريري، والتهاب الضرع السريري المتكرر لدعم التشخيص والمراقبة الدقيقة.
- الكشف المبكر عن التهاب الضرع تحت السريري: يحدد تحولات المجتمعات الميكروبية في الحيوانات التي لا تظهر عليها أعراض، مما يمكن التدخل قبل حدوث خسائر في الإنتاجية.
- تحديد مسببات الأمراض والمؤشرات المميزة: يكشف عن أنواع الميكروبات الرئيسية والأجناس وأنماط المجتمعات المرتبطة بقابلية الإصابة بالتهاب الضرع أو الحالة الصحية.
- رؤى حول الضراوة ومقاومة المضادات الحيوية: فحص جينات عوامل الضراوة (VFGs) وجينات مقاومة المضادات الحيوية (ARGs) المرتبطة بشدة المرض وفشل العلاج واعادة الإصابة.
- تحليل الميكروبيوم الوظيفي: يتنبأ بالمسارات الأيضية والوظيفية التي تتغير أثناء تطور المرض، بما في ذلك استقلاب المغذيات والكربوهيدرات (مثل دورة حمض الستريك).
- المعلوماتية الحيوية المتقدمة وقواعد البيانات: مدعومة بمسارات عمل متينة وقواعد بيانات منسقة (مثل VFDB و ResFinder و KEGG/SEED) للتفسير ذي الدلالة السريرية والبيولوجية.
- التحديد الكمي المطلق الاختياري: يتيح دمج قياس التدفق الخلوي تحويل الوفرة النسبية إلى عدد البكتيريا المطلق لتحسين الدقة بمرور الوقت.
- تقنيات تحليل التسلسل المرنة: يدعم كلاً من التحليل المستهدف لتسلسل الجينوم (S16 ITS/) والتحليل الكامل لتسلسل الجينوم باستخدام تقنية شوتجن بناءً على عمق الدراسة وأهدافها.
- إعداد التقارير القابلة للاستعمال: يترجم بيانات الميكروبيوم المعقدة إلى رؤى واضحة وقابلة للتفسير للأطباء البيطريين والباحثين ومسؤلي القطعان.
سير العمل
الخطوة الأولى: جمع العينات
- يُجمع حليب الحويصلات بطريقة معقمة في نهاية عملية الحلب (عينات مركبة أو عينات من أرباع الضرع).
- تُبرّد العينات فورًا للحفاظ على سلامة الحمض النووي للميكروبات.
الخطوة الثانية: إستخلاص الحمض النووي
- عزل فعال للحمض النووي للميكروبات.
- مُحسَّن لتحقيق أعلى درجات النقاء والإنتاجية.
الخطوة الثالثة: تحليل تسلسل الميتاجينوم الكامل / الميتاجينوميات المستهدفة
- تحليل شامل أو مستهدف لتسلسل جينوم الميكروبات.
- تحديد الكائنات الحية الرئيسية والمؤشرات الوظيفية.
الخطوة الرابعة: تحليل البيانات
- معلوماتية حيوية متقدمة لفهم الميكروبات.
- تقييم مؤشرات الجودة والسلامة والأداء.
الخطوة 5: التقرير
- نتائج واضحة وعملية، مُصمّمة خصيصاً لنظام الإنتاج الخاص بك.
- يدعم اتخاذ قرارات مدروسة بشأن الجودة والإنتاجية.
اكتشف رؤى ميكروبيوم الحليب
تواصل معنا لاستكشاف تحليل ميكروبيوم عالي الدقة وتقارير قابلة للتطبيق مصممة خصيصًا لاحتياجات قطيعك أو أبحاثك.
المعلوماتية الحيوية
