Perfilamiento Integral del Microbioma de la Leche
La inteligencia del microbioma que impulsa hatos más saludables
GTx-Milk empodera a productores lecheros, veterinarios, administradores de hatos e investigadores con información accionable del microbioma para detectar mastitis de forma temprana, reducir recurrencias, mejorar estrategias de tratamiento y proteger la productividad a largo plazo del hato.
Requisitos de Muestra:
- Tipo de Muestra: Leche alveolar, usualmente recolectada al final del ordeño; muestras compuestas (todos los cuartos) o por cuarto individual (cuarto: lóbulo o sección distinta de la ubre).
- Volumen: ~5–10 mL (leche alveolar) o 15–20 mL (muestra general).
- Procedimiento de Recolección: Condiciones estrictamente asépticas; descartar los primeros chorros y desinfectar los pezones (p. ej., etanol al 70 %).
- Almacenamiento: Transporte y almacenamiento inmediatos a bajas temperaturas (−20 °C o −80 °C) antes de la extracción de ADN.
Características:
- Análisis de Alta resolución del Microbioma de la Leche: Perfilamiento de alto rendimiento mediante 16S rRNA y metagenómica shotgun para obtener información precisa sobre virulencia, resistencia a antibióticos y actividades metabólicas.
- Estratificación del Estado de Mastitis: Distingue entre mastitis sana, subclínica, clínica y clínica recurrente.
- Detección Temprana de Mastitis Subclínica: Identifica cambios microbianos en animales asintomáticos antes de pérdidas productivas.
- Identificación de Patógenos y Marcadores Característicos: Detecta especies, géneros y patrones comunitarios asociados a susceptibilidad o salud.
- Información Sobre Virulencia y Resistencia a Antibióticos: Evalúa genes de factores de virulencia (VFGs) y resistencia (ARGs) vinculados con severidad, fallo terapéutico y recurrencia.
- Análisis Funcional del Microbioma: Predice vías metabólicas y funcionales alteradas (p. ej., metabolismo de nutrientes y carbohidratos, ciclo TCA).
- Bioinformática Avanzada y Bases de Datos Curadas: Pipelines validados y bases como VFDB, ResFinder y KEGG/SEED para interpretaciones clínicas y biológicas relevantes.
- Cuantificación Absoluta Opcional: Integración con citometría de flujo para convertir abundancias relativas en recuentos bacterianos absolutos.
- Enfoques de Secuenciación Flexibles: Metagenómica dirigida (16S/ITS) o shotgun según objetivos y profundidad del estudio.
- Reportes Accionables: Traduce datos complejos en información clara para veterinarios, investigadores y gestores de hatos.
¿Cómo funciona?
Paso 1: Recolección de la Muestra
- Leche alveolar recolectada de forma aséptica al final del ordeño (muestras compuestas o por cuarto).
- Las muestras se refrigeran inmediatamente para preservar la integridad del ADN microbiano.
Paso 2: Extracción de ADN
- Aislamiento eficiente del ADN microbiano.
- Optimizado para alta pureza y rendimiento.
Paso 3: Secuenciación Metagenómica Completa / Metagenómica Dirigida
- Secuenciación microbiana integral o dirigida.
- Identifica organismos clave y marcadores funcionales.
Paso 4: Análisis de Datos
- Bioinformática avanzada para obtener información del microbioma.
- Evalúa indicadores de calidad, seguridad y desempeño.
Paso 5: Informe Personalizado
- Resultados claros y accionables, adaptados a su sistema de producción.
- Apoya decisiones informadas sobre calidad y productividad.
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