Reconstrucción Precisa de Genomas Complejos
Transformando Secuencias Fragmentadas en Mapas Genómicos Completos.
GTx-Genome Assembly™ ofrece una reconstrucción genómica de alta fidelidad al ensamblar lecturas crudas de secuenciación en genomas completos, contiguos y anotados. Ya sea para microorganismos, plantas o muestras animales, este servicio permite a los investigadores descubrir la arquitectura genética completa de una especie. Es ideal para proyectos de genoma de novo, genómica comparativa y estudios evolutivos, y respalda aplicaciones posteriores como el descubrimiento de genes, el análisis de variantes y la anotación funcional, garantizando una base genómica sólida para la investigación y el desarrollo en los campos de la salud, la agricultura y las ciencias ambientales.
Aplicaciones:
- Genómica comparativa y estudios evolutivos
- Identificación y caracterización de genes novedosos y elementos funcionales
- Investigación de variaciones genéticas y mutaciones causantes de enfermedad
- Desarrollo de recursos genéticos para la mejora de cultivos y la cría de ganado
- Genómica microbiana
- Genómica ambiental
Características:
- Ensamblaje del Genoma: Reconstruye genomas completos utilizando tecnologías de secuenciación de nueva generación y de tercera generación, obteniendo secuencias precisas y contiguas.
- Preprocesamiento de Datos: Realiza control de calidad, recorte de lecturas de baja calidad, eliminación de artefactos y filtrado de contaminantes para garantizar datos de entrada confiables.
- Ensamblaje de Novo: Reconstruye genomas sin un genoma de referencia, permitiendo el estudio de organismos nuevos o poco caracterizados.
- Ensamblaje Guiado por Referencia: Utiliza genomas existentes como marco de referencia para alinear lecturas, facilitando la detección rápida y precisa de diversos tipos de variantes, incluidas variantes de un solo nucleótido (SNVs) y variaciones en el número de copias (CNVs).
- Anotación Completa: Identifica genes, ARN no codificante, repeticiones, elementos transponibles y variantes estructurales mediante algoritmos avanzados y datos transcriptómicos.
- Anotación Funcional: Asigna significado biológico a los elementos genómicos, incluyendo funciones génicas, dominios proteicos, vías biológicas y elementos regulatorios.
- Evaluación de Calidad: Analiza contigüidad, cobertura, completitud y precisión para garantizar resultados confiables.
- Genómica Comparativa: Detecta regiones conservadas, familias génicas y relaciones evolutivas entre especies.
- Visualización e Interpretación: Proporciona navegadores genómicos, gráficos interactivos y reportes detallados para una exploración sencilla y la obtención de información accionable.
Ensamblaje de Genomas de Alta Fidelidad para Investigación Clínica
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*Toda la información se maneja con estricta confidencialidad.
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