Perfil Abrangente do Microbioma do Leite
A Visão do Microbioma Impulsionando Rebanhos Mais Saudáveis
O GTx-Milk capacita produtores de leite, veterinários, gerentes de rebanho e pesquisadores e cientistas da indústria de laticínios com informações acionáveis do microbioma para permitir a detecção precoce da mastite, reduzir a recorrência, melhorar as estratégias de tratamento e proteger a produtividade do rebanho a longo prazo.
Requisitos da Amostra:
- Tipo de Amostra: Leite alveolar, normalmente coletado ao final da ordenha. As amostras são frequentemente compostas (misturas de todos os quartos) ou amostras individuais de quartos (Quarto: um lobo ou seção distinta do teta da vaca).
- Volume: Aproximadamente 5–10 mL (leite alveolar) ou 15–20 mL (amostra de leite geral).
- Procedimento de Coleta Requer condições assépticas rigorosas. Os primeiros jatos de leite devem ser descartados e as extremidades das tetas devem ser completamente desinfetadas (ex: com etanol 70%).
- Armazenamento: As amostras devem ser transportadas e armazenadas imediatamente a baixas temperaturas (ex: −20 °C ou −80 °C) antes da extração do DNA.
Principais Características:
- Análise do Microbioma do Leite de Alta Resolução: Perfil de alto rendimento de comunidades bacterianas em amostras de leite usando sequenciamento de rRNA 16S e metagenômica shotgun para fornecer informações microbianas detalhadas e precisas, incluindo virulência, resistência a antibióticos e atividades metabólicas.
- Estratificação do Estado da Mastite: Distingue com precisão entre mastite saudável, subclínica, clínica e clínica recorrente para apoiar o diagnóstico e monitoramento precisos.
- Detecção Precoce de Mastite Subclínica: Identifica mudanças microbianas em animais assintomáticos, permitindo a intervenção antes que ocorram perdas de produtividade.
- Identificação de Patógenos e Marcadores de Assinatura: Detecta as principais espécies microbianas, gêneros e padrões de comunidade associados à suscetibilidade à mastite ou ao estado saudável.
- Informações sobre Virulência e Resistência a Antibióticos: Faz a triagem de genes de fatores de virulência (VFGs) e genes de resistência a antibióticos (ARGs) ligados à gravidade da doença, falha do tratamento e recorrência.
- Análise Funcional do Microbioma: Prevê vias metabólicas e funcionais alteradas durante a progressão da doença, incluindo o metabolismo de nutrientes e carboidratos (ex: ciclo do TCA).
- Bioinformática e Bancos de Dados Avançados: Alimentado por pipelines validados e bancos de dados curados (ex: VFDB, ResFinder, KEGG/SEED) para interpretação clínica e biologicamente significativa.
- Quantificação Absoluta Opcional: A integração da citometria de fluxo permite a conversão de abundâncias relativas em contagens bacterianas absolutas para uma melhor precisão ao longo do tempo.
- Abordagens de Sequenciamento Flexíveis: Suporta tanto metagenômica direcionada (16S / ITS) quanto sequenciamento metagenômico shotgun completo com base na profundidade e nos objetivos do estudo.
- Relatórios Acionáveis: Traduz dados complexos de microbioma em informações claras e interpretáveis para veterinários, pesquisadores e gerentes de rebanho.
Como Funciona
Passo 1: Coleta de Amostras
- Leite alveolar coletado assepticamente ao final da ordenha (amostras compostas ou de quartos).
- As amostras são resfriadas imediatamente para preservar a integridade do DNA microbiano.
Passo 2: Extração de DNA
- Isolamento eficiente de DNA microbiano.
- Otimizado para alta pureza e rendimento.
Passo 3: Sequenciamento Metagenômico Total / Metagenômica Direcionada
- Sequenciamento microbiano abrangente ou direcionado.
- Identifica organismos-chave e marcadores funcionais.
Passo 4: Análise de Dados
- Análise bioinformática avançada para informações microbianas.
- Avalia indicadores de qualidade, segurança e desempenho.
Passo 5: Relatório Personalizado
- Resultados claros e acionáveis adaptados ao seu sistema de produção.
- Dá suporte a decisões informadas sobre qualidade e produtividade.
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